Третото залавяне на Филип Тотю станало при тежък бой с турците сутринта на 15 март 1863г. в с.Кортен, Сливенско, след като били заобградени в дома на Стоян Киреза. По това време Тотю бил част от дружината на Никола Аджема, който бил байрактар при Панайот Хитов но се отделил заедно с част от хората му за да прекарат по-леко зимата. След продължителна битка седмината обградени хайдути били принудени да излезат от къщата, понеже турците успели да я подпалят. Ето как описва ситуацията Тотю: “ Аз взех бърже една женска дреха и я вързах на една прътина. Казах на другарите си, че щом покажа дрехата навън и турските пушки изгърмят върху и, всеки да излиза подире ми и да се спасява кой както може с пищова си и ножа си, докато турците си напълнят пушките пак. Веднага отворих вратата, посочих дрехата с прътината навън и турците изгърмяха върху и, като я мислеха за человек, а след това с нож в уста и пищовите си в ръце излязох, впуснах се към дола, изгърмях върху турците и с ножа си отворих път през тях, прегазих ги и минах. Но куршумите отвсякъде се сипеха като дъжд отгоре нас, раниха ме на много места и паднах.
Тук падна убит Дългия Георги от с.Оризари, а всинца ний бяхме полумъртви и потънали в кърви. След това дойдоха, нахвърлиха ни в едни кола като снопи и ни закараха в Нова Загора, гдето заровиха Дългия Георги в един боклук, а нас после два дни ни закараха в Сливен и ни затвориха в затвора, оковани в синджири. . . .
Тежко бяхме оковани тук! Ръцете ни бяха в железни клапи, а вратовете ни – в железни халки и всичките халки от вратовете на всинца ни бяха нанизани на един синджир, едина край на който беше забит в зида, а другият му край обтягаха и го закачаха през другия зид вън. Тъй нанизани на този синджир за халките на вратовете ни и с оковани ръце, ноще ни турваха и томруци на краката.“ ( Томрукът представлява – два дълги диреци, сложени един върху други с изрязани две дупки в тях, дето се срещат. Вдига се едина дирек, турват се двата крака поотделно в изрязаните места и се турва горния дирек върху краката тъй, щото да доди изрязаната му полудупка върху длабовете на долния дирек и краката остават заключени. Двата дирека се приклапят добре и се заключват с кофар на краищата си, да не може да ги стига затворникът.)
Въпреки условията, при които е поставен, Филип Тотю не се отказва от мисълта за бягство и споделя със съкилийниците си, че ще търси начин да избяга.При едно посещение в тоалетната той намира там едно желязо и го скрива. Между тях обаче имало един грък на име Пантели, който предупредил пазачите, че Тотю иска да избяга. Като разбрали това затворниците решили да се отърват от предателя, ето как описва това войводата:
„Една нощ тъй като седяхме и се разговаряхме, решихме да заплатим на гърка и затова го повикахме при нас да ни прави цигари, понеже него не вържеха при нас на синджира и не беше окован, а свободен. Той дойде седна при нас и почна да ни прави цигари. Наговорката ни беше, че когато ще почнем да го отупвами, всяки от нас ще почне да пей, та ако почне да вика, да не се чува. Докато той се занимаваше да прави цигари, ний почнахме да пеем следующата турска песен „На туй дере шумоленето колко приятно ми иде“ Гръкът докато пригласяше и той на тази наша песен, аз и малкият Колю сполучихме да го сграбим за гушата, а Костадин Джиналията и Неделчо го натиснаха по корема и следвахме да пеем песента, докато гръкът се отпусне и се потаи духа му. Той издъхна в ръцете ни и тогаз престанахме да пеем.“
Въпреки подозренията на власта, затворниците начело с Филип Тотя не се отказват от бягството и в крайна сметка успяват. Ето разказа на Филип Тотю:
„Като останахме без издайника, крояхме вече ден и нощ за бягане. Портата на нашата гробница имаше две врати, които са затваряха на едно дебело и яко дърво, което стоеше на средата им, кога се влизаше, а другата стоеше винаги затворена, защото беше закована с два яки и големи пирони в дебелото дърво. Аз турих око на тези пирони и всеки ден ги разклащах и ги мажех с масло от кандилото, което ни светеше нощя и правеше затвора ни на същински голям гроб от живи хора. Нищо друго не държеше тази врата. На вратата имаше резе, с което зарезяваха на другата врата и заключваха двете с кофар. Вън пред тези порти пазеха денонощно двама души караул, въоръжени, едина войник, а другият заптия.След няколко дни видях, че пироните се разслабиха и се извадиха. Аз ги турих пак на мястото им и ги попритиснах. . . Мръкна се. Минутата на страшната борба за живот или смърт наближаваше. Най-първо строшихме томрука на краката си и успяхме да отворим железните клапи от ръцете на малкия Коля, а той след това помага нам и можахме да махнем всички клапите от ръцете си. Най-после сполучихме да откопчим и халките от вратовете си и ги оставихме да висят на синджира. Всичко това извършихме с онова малко желязо, което намерих в нужника. И досега подозирам и ми се иска да вярвам, че Георги, братът на Хаджи Димитра Асенов, беше турил това желязо в нужника. Както и да е, но това желязо стана нашият спасител в другарство с дървеното масло от кандилото на гробницата ни. Останаха по нас прангите само по краката ни, на които малкото наше освободителче- желязо, не можеше нищо да стори. Аз веднага дадох идеята всеки да си върже прангите на пояса, като ги обвие да не дрънкат. Казано и свършено. Прангите, тъй да речем, се опаковаха на краката и на кръста на всеки го и никакъв звук не издаваха. Другарите ми още не знаеха нищо и се чудеха през къде ще се бяга, защото над нас беше казармата, в която спяха войници, а пред нас зад портата караул. Тогаз им казах през къде ще бягаме и наредих малкият Колю да хване жандармина, а пък аз войника. Наближаваше полунощ Ослушах се, тихо. Минутата дойде. Полека извадих пироните и отведнъж отворих вратата, сграбих пушката на войника и го прободох с щика, а малкият Колю удари жандармина с едно дърво в главата, която се размаза, без глас паднаха, скочихме върху им и ги заминахме като вихри, защото минутите бяха скъпи за живота ни. Бързо налетяхме пътната порта, в която имаше малка изрязана порта. Тук имаше втори караул от един войник и тъй скоро преминахме през него като нощни духове, щото той не можа да успей да употреби оръжието си, понеже беше седнал и, вижда се, беше задремал. Той ни усети и изгърмя подире ни, но ний бяхме вече на улицата и хвръкнахме!“


